酸性玻璃胶和中性玻璃胶在用途、性质、固化速度、美观程度上存在显著差异‌。

• ‌用途‌：酸性玻璃胶主要用于室内外密封、堵漏、防风雨，室内防渗防漏效果更佳。中性玻璃胶则适用于各种幕墙密封，尤其是玻璃幕墙、石材干挂密封，也可用于金属、玻璃、铝材、瓷砖等接缝密封‌。
• ‌性质‌：酸性玻璃胶固化时释放乙酸气体，有刺激性气味，但会逐渐消失。中性玻璃胶固化时释放乙醇气体，无刺鼻气味‌。
• ‌固化速度‌：酸性玻璃胶固化速度较快，但具有腐蚀性，易腐蚀金属。中性玻璃胶固化速度较慢，延展性较差，但粘接性强‌。
• ‌美观程度‌：酸性玻璃胶比中性玻璃胶更美观，后者使用时易出现褶皱、不平、粗糙等现象‌。